黑枸杞在中国主要分布于青海、新疆、甘肃、宁夏、西藏等地，这些地区的部分区域因独特的自然环境成为黑枸杞的优势产区。
青海柴达木盆地
- 气候条件优越：柴达木盆地海拔高，气候干旱少雨，年降水量仅 30-80 毫米，晴天多，日照时间长，昼夜温差大，有利于黑枸杞进行光合作用和营养物质的积累，促使其花青素含量大幅提高。
- 土壤条件适宜：盆地内土壤盐碱化程度高，富含多种矿物质，为黑枸杞的生长提供了特殊的土壤环境，适合黑枸杞耐盐碱的生长特性，使得黑枸杞在这里能够茁壮成长，果实饱满，果皮较厚，营养丰富。
新疆部分地区
- 和田地区：位于昆仑山北麓，属于温带大陆性干旱气候，干旱少雨，日照充足，年日照时数达 2600-3000 小时，温差大，土壤为沙质，排水良好，适合黑枸杞生长。这里产出的黑枸杞果粒较大，口感甘甜，外观上颗粒饱满，色泽鲜艳。
- 若羌、且末等地：降水远远低于蒸发量，符合黑枸杞耐旱的特性，充足的日照时长，使得黑枸杞在光合作用中不断积累能量，昼夜悬殊的温差，又减少了营养的消耗，让养分得以充分沉淀。此外，新疆的土壤富含多种矿物质和微量元素，纯净的高山冰雪融水为其提供水源，在这些自然条件的共同滋养下，黑枸杞茁壮成长，果实愈发饱满，营养成分也更为丰富。
甘肃河西走廊
- 地处祁连山北麓，气候干旱少雨，光照充足，年日照时数可达 3000 小时以上，温差大，有利于黑枸杞果实中糖分和花青素等营养成分的积累。土壤为沙质，富含矿物质，能满足黑枸杞生长对土壤肥力和透气性的要求。所产黑枸杞果粒均匀，色泽鲜艳，口感纯正，品质优良，代表产区有敦煌市、瓜州县、玉门市等地。
宁夏
- 宁夏地处内陆干旱区，属于温带大陆性气候，光照充足，昼夜温差大，能够促进黑枸杞果实中营养物质的积累。其土地肥沃，引黄灌溉便利，为黑枸杞的生长提供了良好的水分和土壤条件。当地生产的黑枸杞色泽黑亮、果实饱满、滋味甘美。
西藏阿里地区
- 平均海拔 4500 米以上，气候高寒干燥，紫外线强，空气稀薄，昼夜温差大，这种独特的高原气候条件使得黑枸杞的生长周期较长，有利于营养成分的积累，其花青素含量极高，营养价值高。土壤贫瘠但富含微量元素，黑枸杞的抗逆性强，果实相对较小，但品质优良，代表产区有普兰县、札达县等地。
